《菌物学报》是中国科学院微生物研究所和中国菌物学会联合主办，中国科学院主管的学术刊物。1982年创刊，现为月刊。现被国内外……多个文献检索数据库收录。据中国知网《中国学术期刊影响因子年报（2022）》，《菌物学报》最新影响因子2.406；在《科技期刊世界影响力指数（WJCI）报告（2022）》中世界影响因子1.427。

《菌物学报》是中国自然科学核心期刊，第四届中国精品科技期刊，入选中国精品科技期刊顶尖学术论文F5000项目；5次被评为“中国具国际影响力优秀学术期刊”；2020年科普专栏入选中共中央宣传部学习强国平台（大自然-自然科普和每日物种故事）；2021年入选中国科学技术协会第六届中国科协优秀科技论文遴选计划。

《菌物学报》主要刊登我国菌物学（包括真菌、黏菌、卵菌）研究领域在理论上和实践上的最新研究成果，报道内容包括菌物多样性、系统分类学、起源与进化、菌物区系地理学、生态学、遗传学、生理学、生物化学、濒危菌物物种保护生物学以及食药用真菌、有毒真菌、真菌毒素、人类病原真菌、植物病原真菌、兽医真菌、互惠共生菌物等方面的研究论文、简报和综述。